红山区
包含了金沙江流域典型的高原夷平面，高山喀斯特等地貌特征完整的古冰川遗迹和丰富的植物生态系统、高原湖泊等多种景观类型，是"三江并流"世界遗产提名地景观资源价值的典型展示区。其中，以尼汝南宝草场、小雪山丫口高原地质景观最具典型意义。 尼汝--南宝草场集中了高原冰蚀湖--属都湖，高山草甸--地基淌、南宝，硬叶常绿阔叶林生态系统，古冰川遗迹(南宝)，河谷人居环境(尼汝河)高原泉华瀑布(七彩瀑布)等类型多、范围大、分布集中的景观资源，是具有极高保护价值和开发潜力的原始景观资源研究展示区域。同时，南宝河的古冰川地貌遗迹是"提名地"范围内发育最完整，展示最集中的第三期冰川地质遗迹。
千湖山区
在位于迪庆州香格里拉县小中甸乡包括小中甸乡和上江乡的局部地区，是金沙江流域原始植被、高原湖泊的集中展示区之一。
千湖山片区遍布高山冰蚀湖。据不完全统计，大小不一的高原湖泊有一百多个。其中以碧古天池和三碧海为代表。具有独特的高原森林湖泊景观价值。
云岭片区
位于怒江兰坪县境内澜沧江与其支流通甸河之间。
据调查，栖息在本保护区内的滇金丝猴共有4群，约占滇金丝猴现存总数1500-2000只的10%。这可能是我过特产的滇金丝猴分布区最南端的种群，有极其重要的保护价值。该保护区森林覆盖率高达76%，大多保持原始状态，生物多样性相当丰富。区内野生动物分布广泛，据初步调查，共记录到哺乳动物28种，隶属7目13科。
老君山区
是"三江并流"范围内金沙江流域下游，主要包含了金沙江流域的"高原冰蚀湖群"，"黎明黎光丹霞地貌片区"作为"三江并流"提名地内典型的高山丹霞地貌集中发育区和金沙江流域景区展示和规范化保护管理示范区，具有典型的代表性。 在金丝厂，九十九龙潭附近的高原湖泊周围，在海拔3200米以上呈杜鹃纯林生态系统，杜鹃种类多达100种，是金沙江流域杜鹃花种类最丰富的分布区。杜鹃林与高山湖泊共同构成了精彩的景观画卷。丽江老君山分布着中国面积最大、发育最完整的丹霞地貌奇观，它镶嵌在莽莽原始森林的万绿丛中，璀璨夺目。有不少红色岩石表面风化形成龟裂状构造，其中一座山坡形如千万只小龟又组成一只大龟，排列自然而有序，仿佛向着太阳升起的东方行进。
老窝山区
位于澜沧江流域下游，迪庆藏族自治州维西僳僳族自治县，澜沧江西岸中挑和维登乡境内，是澜沧江流域的景观资源类型补充片区，以高山湖泊、高原草甸和野生花卉资源为保护重点，主要景点包括新化湖、老窝山高山冰积湖群，澜沧江二级支流拉洛河、红岩洞溶洞、栗地坪野生花卉等，仍处在原始未开发阶段。
